嵯峨天皇の後の天皇も度々皇族を源氏として臣籍に下したことから、嵯峨天皇を祖とする源氏を
嵯峨源氏と称する様になり、以後源氏はそれぞれの祖と仰ぐ
天皇の号をもって氏族の称とした(仁明源氏、
文徳源氏、
清和源氏、宇多源氏など)。また、
朝廷が皇族を臣籍降下させ源氏とした背景としては、上級
貴族として皇室の藩塀とすることという理由もあったが、実際には3代目以降も上級貴族であり続けた例はほとんどなく、大半は
受領階級として地方へ赴任しそこで土着して
武士化するか、中央で中下級貴族として細々と生き延びた。他に、皇族に対して賜った姓としては、他に
在原朝臣、
平朝臣などがある。
中央貴族として栄えた源氏として
村上天皇の皇子を祖とする
村上源氏がある。同じ源氏でも
公卿として繁栄する系統や、武士や神官となる系統に別れるのは、政治情勢や臣籍降下する者、母方の勢力や身分がその後の官途に大きく左右する為である。特に天皇の皇子が降下することを、「
一世の源氏」といい、任官の上で大いに優遇された。皇孫に至って臣籍降下することを「
二世の源氏」といい、一世の源氏よりも家系的には不利を蒙った。